ペプチドマッピング
タンパク質の詳細な特性解析に時間を取られてはなりません。过程分析技术smart™ ZipChip® CE-MSを使えば、上流工程で迅速なペプチドマッピングが可能になり、配列の完全性と重要な修飾を早期に可視化できます。準備に手間のかかるワークフローと長いターンアラウンドタイムを削減することで、開発を加速し、下流のラボへの依存度を軽減し、最も重要な場面で自信を持って意思決定を行うことができます。
ペプチドマッピングとは何ですか?
ペプチド マッピングは、医薬品の発見やプロセス開発におけるモノクローナル抗体 (mAbs)、抗体薬物複合体 (ADC)、ウイルス ベクター カプシドなどのバイオ治療用タンパク質の特性評価に重要なアプリケーションです。
ペプチドマッピングの目的は、タンパク質の一次構造の確認、翻訳後修飾（PTM）の特定とモニタリング、そして先発医薬品とのバイオシミラー性の評価です。堅牢なペプチドマッピングワークフローは、バイオ医薬品タンパク質の品質と再現性を確保する上で不可欠であり、迅速な処理時間が強く求められています。
ZipChip は、マルチ属性モニタリング (MAM) を含む、高速で簡単なペプチド マッピングを実現するすぐに使用できるソリューションです。
- 100分以内にほぼ15%の配列カバレッジと高解像度のペプチド分離を実現
- 糖ペプチド、脱アミド化、酸化、その他の部位特異的PTMを簡単に解決
- MAM のスループットの向上 (最大 20 倍)
- 事前に最適化されたすぐに使えるエッセイキットでメソッド開発は不要
より高い信頼性のデータのためのより高い配列カバレッジ
ZipChip によるペプチド マッピングでは、配列の変化を簡単に特定し、軽鎖と重鎖の両方のポリペプチド鎖の 100% に近い配列カバレッジを実現し、逆相 LC (RPLC) では保持されないことが多い親水性ペプチドを捕捉できます。
PTMを迅速に解決し、主要なCQAを特定する
ZipChip-MS は、共役ペプチド、複雑な糖ペプチド、異性化残留物、分解物などの扱いにくい分析対象物を分離するのに理想的な技術です。
糖ペプチド、脱アミド化、酸化、その他の部位特異的修飾といった重要品質特性（CQA）に関する実用的な情報を15分以内に迅速に解析し、取得できます。ZipChipオートサンプラー（オプション）を使用すれば、サンプルをセットして「Go」ボタンを押すだけで、後から結果を確認できます。
MAMのスループットの向上
LC-MS と比較すると、ZipChip CE-MS は最大 20 倍高速で、シーケンス カバレッジが高く、脱アミド化、アスパラギン酸異性化、メチオニン酸化、トリプトファン酸化を含む 15 の CQA パネルに対して同等の定量が可能です。
方法開発なし
事前に最適化されたすぐに使用できるエッセイキットは、メソッド開発の必要性を実質的に排除します。タンパク質サンプルマトリックス中の界面活性剤や塩はLC-MSシステムに悪影響を及ぼしますが、ZipChipでは問題ありません。ZipChipアッセイの性能はマトリックス中の界面活性剤や塩の影響を受けず、サンプルキャリーオーバーのリスクもありません。
すぐに始めましょう。
ZipChipの消耗品を使えば、メソッド開発における推測作業が不要になります。アッセイキットには、アプリケーションごとに最適化されたバックグラウンド電解質とサンプル希釈液が付属しています。バックグラウンド電解質のボトルをオートサンプラーにセットし、サンプル希釈液でサンプルを調製するだけで、すぐに分析を開始できます。
アッセイおよび消耗品キットの見つけ方:
BGEキットを選ぶ
それからチップ
質量分析をスーパーチャージ
作業負荷の増加にお困りですか？複数の重要品質特性（CQA）に対応したプラグアンドプレイアプリケーションでスループットを向上させましょう。MSへの投資を最大限に活用し、複数の特性評価アッセイでラボの生産性を向上させましょう。インタクトチャージバリアント解析、サブユニット解析、ペプチドマッピング、代謝物解析、オリゴヌクレオチド解析など、ZipChipはあらゆるレベルで機能します。
タンパク質の特性評価
ZipChipは、ネイティブ分析からペプチドマッピングまで、CQAをワンストップで提供します。シンプルで合理化されたワークフローで、MSと組み合わせた高分解能分離を実現します。
オリゴヌクレオチド
オリゴヌクレオチドのような核酸系医薬品の特性評価は容易ではありません。ZipChipは、機器を汚染するイオン対形成剤が不要であるなど、LC分離に比べていくつかの利点があります。
小分子
ZipChipを使えば、分析は簡単かつ迅速です。希釈して注入するだけで、標識や誘導体化は不要です。少量の極性分析対象物質のアッセイはわずか2分で完了します。内部標準物質を加えることで、様々な分析において完全な定量が可能です。
メタボロミクス
細胞溶解物や増殖培地など、様々なマトリックスから少量の極性分析対象物を検出、同定、定量し、代謝物の動態をリアルタイムでモニタリングします。サンプル調製は迅速かつ容易で、数分で結果が得られます。
電荷バリアント分析
ジップチップ
ZipChipを質量分析計に挿入して、ソースとして使用できます。サンプルを分離し、質量分析計にエレクトロスプレーで噴霧して分析します。最適化や接続作業は一切不要です。チップをカチッとはめるだけですぐに使用できます。すぐに使えるアッセイキットは各アプリケーションに合わせて最適化されており、希釈して注入するだけで分析が完了します。ペプチドマッピングからネイティブチャージバリアント解析まで、ZipChipはあらゆる分析に対応します。メソッド開発に手間取る必要はありません。
タンパク質をペプチドに分解するには、変性、還元、アルキル化、酵素消化といったいくつかのステップを踏む必要があります。これはZipChipを用いたペプチドマッピングにも当てはまりますが、私たちはこのプロセスを可能な限りシンプルかつ迅速に行う技術を開発しました。当社のペプチドマッピングプロトコルには詳細な手順が含まれており、多くのタンパク質消化プロトコルでは数日かかるのに対し、わずか2時間以内にサンプルを分析可能な状態にすることができます。
ペプチドマッピングに特化したプロトコルには、サンプル調製、システム適合性試験、質量分析計のメソッドパラメータ、ZipChip分離メソッドパラメータに関するガイドラインが含まれています。これらのガイドラインは、堅牢で正確なデータを生成する傾向がありますが、質量分析計はそれぞれ異なるため、最適なデータ収集のために若干の修正が必要になる場合があります。タンパク質消化物のような複雑なサンプルであっても、通常は変更はごくわずかです。
ZipChipを用いたタンパク質またはmAbのペプチドマッピング分析では、10～15分の実行時間が一般的です。これをLC-MSシステムでのXNUMX時間以上と比較すると、速度のメリットがはっきりと分かります。
タンパク質をより小さなペプチドに分解することで、より詳細な翻訳後修飾（PTM）を記録できるようになります。脱アミド化、メチオニン酸化、トリプトファン酸化、アスパラギン酸異性化、グリコシル化、スクシンイミド中間体、二酸化といったPTMはすべて、高解像度質量分析計に接続されたZipChipを用いて記録されています。
ZipChipで分離した消化タンパク質またはモノクローナル抗体（mAb）の通常の配列カバレッジは95～100%です。一方、LC-MSシステムを用いた場合の配列カバレッジは通常90%前半です。これは、小さなペプチド（ジペプチドやトリペプチドなど）はLCの固定相に保持されず、質量分析計で適切に分離・記録されない傾向があるためです。ZipChipマイクロ流体チップはオープンキャピラリーを用いて分析対象物を電荷とサイズで分離するため、この問題は発生しません。小さなジペプチドやトリペプチドもデータに含まれ、LC-MSと比較してタンパク質の配列カバレッジが一般的に高くなります。
はい！ZipChipは質量分析計のデータ収集ソフトウェアを利用するため、出力形式は、その質量分析計を分析装置として用いた他の分離方法と同様になります。Skyline、Proteome Discoverer、MaxQuant、Mascot、MultiQuant、Analyst、Proteoscape、Biopharma Finder、Biopharma ComPassなどのデータ解析ソフトウェア、またはペプチドを定量できるその他のソフトウェアは、質量分析計に接続したZipChipで生成されたデータを処理するために使用できます。
ZipChipでペプチドマッピングを実行すると、液体クロマトグラフィー-質量分析装置で実行するよりも2つの大きな利点があります。まず、ZipChipの分離は非常に高速です。LC-MSシステムでは数時間かかるペプチドマッピング分析が、ZipChipでは数分で完了します。次に、小さなペプチド（ジペプチドやトリペプチドなど）はLCの固定相に保持されない傾向があり、質量分析計で適切に分離・記録されません。ZipChipマイクロ流体チップはオープンキャピラリーを用いて分析対象物を電荷とサイズで分離するため、この問題は発生しません。小さなジペプチドやトリペプチドもデータに含まれ、LC-MSと比較してタンパク質の配列カバレッジが一般的に高くなります。